Aktuelle Masterarbeitsthemen der Forschungsgruppe Pharmazeutische Biologie
Current Master's Theses-Projects of the Research Group in Pharmaceutical Biology
| Forschungsgebiet Research Field | Kontakt Betreuer/in Contact Supervisor | MSc Pharmazie | MSc Drug Sciences | Bemerkungen Comments |
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Biosynthesis of bacterial natural products Information: The work will comprise the investigation of enzymatic tailoring steps for the formation of bioactive tropone or polyketide natural products from terrestrial and marine bacteria, which often serve as antibiotics or toxins. The work will include gene cloning and heterologous production of proteins in Escherichia coli as well as the biochemical investigation of enzyme functionalities, e.g., by photometric and/or HPLC-based assays. Enzymatic products and intermediates will be identified by LCMS and NMR spectroscopy. The goal is to elucidate the underlying enzymology and gain a better understanding of how these compounds are formed in bacteria. This work will be conducted in the laboratory of the Pharmaceutical Biology at the Pharmacenter, University of Basel. Methods: Molecular biology & protein purification, enzyme assays, HPLC-MS, various chromatographic techniques, NMR for structural characterization of enzyme products | Prof. Robin Teufel | yes | yes | |
No longer available Effects of Plant Extracts on mitochondria in human glioblastoma cells
| Professor Anne Eckert, PhD Head, Neurobiology Laboratory for Brain Aging and Mental Health | yes
| Psychiatric University Clinics (UPK Basel) Wilhelm Klein Strasse 27 CH-4002 Basel, Switzerland Phone: 0041 61 325 5487 E-mail: anne.eckert@clutterupk.ch; anne.eckert@clutterunibas.ch Master thesis can be written in English or German | |
Der «Reinigungstrank Natürlich» – Geschichte des zurzeit ältesten pflanzlichen Tierarzneimittels der Schweiz sowie Pharmakognosie und phytochemische Analyse des Rohstoffs Lindenrinde In der biologischen Landwirtschaft haben pflanzliche Tierarzneimittel einen hohen Stellenwert. Tiere sollen vorzugsweise komplementärmedizinisch behandelt werden, z.B. mit Phytotherapie. Dies ist in der Bioverordnung festgehalten. Die gesetzliche Zulassung von pflanzlichen Arzneimitteln ist jedoch aufwändig – so gibt es aktuell in der Schweiz nur noch drei rein pflanzliche Tierarzneimittel. Eines davon ist der «Reinigungstrank Natürlich» (https://www.reinigungstrank.ch/) der Familie Suhner. Er ist zugleich das derzeit älteste Tierarzneimittel der Schweiz, mit einer Erstzulassung von 1936. Reinigungstränke werden Kühen traditionell nach der Geburt verabreicht, um die Rekonvaleszenz nach dem Kalben zu unterstützen, insbesondere die Regeneration der Gebärmutter. Der einzige Bestandteil des «Reinigungstrank Natürlich» ist Lindenrinde in Pulverform. Nachdem der letzte aktive Hersteller Fritz Suhner im Jahr 2022 verstorben war, hat eine engagierte Drogistin vor kurzem die Produktion wieder aufgenommen. Die Mutter von Fritz Suhner verfügt derzeit noch über eine breite und tiefe Erinnerung an alle drei Generationen, die dieses Tierarzneimittel hergestellt und vertrieben haben. Zudem liegt hierzu auch umfangreiches schriftliches Material vor. Auch Rückstellmuster aus mehreren Chargen der vergangenen Jahre (sowohl des Fertigarzneimittels als auch der Rohstoffe) liegen vor und über die Adressen der ehemaligen und aktuellen Rohstofflieferanten lassen sich weitere Proben des Rohstoffs Lindenrinde sowohl aus der Schweiz als auch aus Europa beziehen. Aufgaben im Einzelnen:
Die Masterarbeit sollte in Form eines wissenschaftlichen Manuskripts verfasst werden. | yes | Contact supervisor: Tel. +41 (0)62 865 72 72, Arbeitsort: | ||
No longer available In vitro safety assessment of microplastic during pregnancy
| Prof Dr. phil II Ana Paula Simões-Wüst | yes | Arbeitsort: University Hospital Zurich, Department of Obstetrics | |
No longer available Herbal preparations for topic applications: prescribing patterns at the Klinik Arlesheim and evidence and gap map | Prof Dr. phil II Ana Paula Simões-Wüst Dr. Daniel Krüerke | yes | no | Arbeitsort Klinik Arlesheim, keine Laborarbeit. |
No longer available Characterization of a tropical fruit extract as a potential new prebiotic | Prof. Olivier Potterat | yes | no | |
No longer available Search for new glioblastoma inhibitors in plant extracts | Prof. Olivier Potterat | yes | no | |
No longer available Discover novel inhibitors for melanoma treatment | Dr. Eliane Garo | yes | yes | |
No longer available Target identification for novel natural product inhibitors of oncogenic MAPK/ERK and PI3K/AKT pathways in melanoma
| Dr. Eliane Garo | no | yes | This work will be conducted in the laboratories of the Pharmaceutical Biology research group at the University of Basel under the direct supervision of PhD student Maria Karpouchtsi. |
No longer available Natural product discovery pipeline to identify antidotes against amatoxin toxicity: Targeting OATP1B3-mediated uptake | Dr. Eliane Garo and Dr. Anima Schäfer | nein | ja | This is a multidisciplinary project and the student will be supervised by both Anima Schäfer (Biopharmacy) and Eliane Garo (Pharmaceutical Biology). This project is therefore advertised in both groups. |
No longer available Über den Tellerrand geschaut – Gurken zur Behandlung von Trockenem Auge | Prof. Olivier Potterat / Prof Carsten Gründemann | ja | Zusammenarbeit von Pharmazeutischer Biologie (Prof. Olivier Potterat) und Translationaler Komplementärmedizin (Prof. Carsten Gründemann) | |
No longer available Characterization of a tropical fruit extract as a potential new prebiotic | Prof. Olivier Potterat | ja | nein | |
No longer available Analytical investigations on Bryophyllum pinnatum extracts in the context of GABAA receptor modulation | Prof. Olivier Potterat | yes | no | |
No longer available Search for new Cas9 modulators in plant extracts | Prof. Olivier Potterat | ja | ||
No longer available Natural Products active on Musashi (MSI) | Dr. Eliane Garo | ja | ||
No longer available Biosynthesis of bacterial tropone natural products | Prof. Robin Teufel | ja | ||
No longer available Search for new Cas9 modulators in plant extracts | Prof. O. Potterat | ja | ||
No longer available Natural Product active on Musashi (MSI1) | Dr. E. Garo | ja | ||
No longer available Target Identification for MAPK and ERK pathway | Dr. E. Garo | ja | ja | |
No longer available Phytochemical profile and bioactive constituents of the stinking hellebore (Helleborus foetidus) | Prof. O. Potterat | ja | ||
No longer available Metabolite profiling of Hibiscol®, a food supplement containing chokeberry and hibiscus extracts | Prof. O. Potterat | Ja | Nein | |
No longer available Isolation of bufadienolides from Bryophyllum pinnatum and B. daigremontianum | Prof. O. Potterat | ja | nein | |
No longer available Identifying Natural products inhibiting the mTOR Complex1 (mTORC1) | Dr. E. Garo | ja | nein | |
No longer available Protective effects of polyamines and/or wheat germ extract on mitochondrial activity and viability in an Alzheimer’s disease cell culture model | Prof. Anne Eckert | ja |